Silikonslang av livsmedelskvalitet rekommenderas i allmänhet inte att komma i direkt kontakt med desinfektionsmedel. Även om silikonrör kan tolerera vissa kemikalier i vissa fall, innehåller desinfektionsmedel ofta starka oxidanter, klorider, alkoholer eller andra frätande och reaktiva kemiska komponenter som kan reagera med silikongel, vilket orsakar ytkorrosion, härdning, missfärgning eller prestandaförsämring av silikonröret.
Till exempel, även om reaktionen mellan natriumhydroxid och silikongel är relativt mild vid rumstemperatur, kan den genomgå en våldsam reaktion vid höga temperaturer, vilket påverkar prestandan hos silikonrör. På samma sätt har klorinnehållande desinfektionsmedel som natriumhypoklorit starka oxiderande egenskaper och kan skada den kemiska strukturen hos silikagel. Även om alkoholdesinfektionsmedel är mindre irriterande, kan långvarig exponering också ha negativa effekter på silikongel.
